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蚌埠医学院是国家第一批卓越医生教育培养计划试点高校、国家级大学生创新创业训练计划首批试点高校、安徽省高校综合改革首批试点单位，是暨南大学、陆军军医大学博士研究生联合培养单位和安徽省博士后岗位设置单位。学校创建于1958年7月，由原上海第二医学院分迁和安徽医学院援建而成，1968年改称蚌埠反修医学院，1970年9月，与安徽医学院合并，改名为安徽医学院蚌埠分院，1974年6月，恢复称蚌埠医学院。